জিনগুলি বিশেষ ফাংশন জিজি কোট; ভাসা জিজি কোট; অনুরূপ বন্য উদ্ভিদের স্ট্রেনগুলিতে, এগুলি ভেষজনাশক প্রতিরোধী এবং নিয়ন্ত্রণ করা শক্ত করে তোলে; বা কীটনাশকের বিরুদ্ধে অ্যান্টিবডি তৈরি করতে পোকামাকড় সৃষ্টি করে। এছাড়াও, কিছু ছোট প্রাণী কীটনাশক কার্যক্রমে জিনগতভাবে পরিবর্তিত উদ্ভিদগুলি খাওয়ার পরে বিলুপ্ত হতে পারে। সমর্থকরা উল্লেখ করেছিলেন যে কৃষিক্ষেত্র নিজেই একটি ক্রিয়াকলাপ যা পরিবেশকে ক্ষতি করে এবং জেনেটিকালি পরিবর্তিত শস্যগুলি traditionalতিহ্যগত কৃষির চেয়ে পরিবেশের বেশি ক্ষতি করতে পারে না। গাছপালা পোকামাকড় প্রতিরোধ করার ক্ষমতা রাখে এবং কৃষকরা কীটনাশক স্প্রে কমাতে পারে যা পরিবেশ এবং জৈব সুরক্ষার পক্ষে উপকারী।
এই জাতীয় বিরোধগুলি অল্প সময়ের মধ্যে সিদ্ধান্তগুলি আঁকানো সহজ নয়। জিনগতভাবে পরিবর্তিত ফসলের বিতর্ককে একটি সাধারণ ঘটনা বলা উচিত। প্রথমত, নতুন বিকাশযুক্ত জাতগুলি নিজেরাই নিখুঁত নয় এবং তাদের মানব দেহ এবং পরিবেশের উপর মধ্য থেকে দীর্ঘমেয়াদী প্রভাব দেখা যায়। বৈধ কারণে লোকেরা তাদের উদ্বেগ প্রকাশ করে। দ্বিতীয়ত, সবসময় কিছু রক্ষণশীল মানুষ থাকবেন যারা নতুন প্রযুক্তি পণ্যগুলিতে অভ্যস্ত নন এবং সেগুলি মানতে অস্বীকার করেন। তারপরে স্বার্থের বাণিজ্য দ্বন্দ্বের প্রভাব রয়েছে। কিছু দেশের সরকার এবং আগ্রহী গোষ্ঠীগুলি বাণিজ্য যুদ্ধে লড়াই করার জন্য জিনগতভাবে পরিবর্তিত খাবারের অপ্রতুলতা ব্যবহার করে জিনিসগুলিকে আরও জটিল করে তোলে।